Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcbP68404 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcbP68404 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms