Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk1P63239 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pcsk1P63239 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pcsk1P63239 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pcsk1P63239 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcsk1P63239 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pcsk1P63239 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk1P63239 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms