Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Crnkl1P63154 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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