Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsnl1P62761 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms