Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms