Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ActbP60710 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ActbP60710 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ActbP60710 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms