Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcbp1P60335 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms