Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp3P58854 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms