Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm2P58774 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms