Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P58686 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P58686 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P58686 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P58686 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P58686 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms