Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Paxbp1P58501 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms