Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dpf3P58269 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms