Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpa1P57784 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms