Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms