Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lim2P56563 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lim2P56563 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lim2P56563 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lim2P56563 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lim2P56563 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms