Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CdaP56389 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CdaP56389 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CdaP56389 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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