Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms