Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc16a1P53986 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms