Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fdft1P53798 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fdft1P53798 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fdft1P53798 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fdft1P53798 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fdft1P53798 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fdft1P53798 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fdft1P53798 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fdft1P53798 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fdft1P53798 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fdft1P53798 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms