Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41l4aP52963 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms