Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dbx1P52950 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms