Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms