Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MipP51180 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MipP51180 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MipP51180 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MipP51180 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms