Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa6P50704 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms