Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpdP50404 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms