Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psen1P49769 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms