Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CitP49025 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CitP49025 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CitP49025 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CitP49025 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CitP49025 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms