Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LmnaP48678 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms