Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx1P48377 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms