Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VdrP48281 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VdrP48281 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms