Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Resp18P47939 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms