Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nedd4P46935 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms