Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms