Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sipa1P46062 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms