Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf5P43027 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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