Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TfamP40630 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TfamP40630 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TfamP40630 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms