Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tjp1P39447 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tjp1P39447 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms