Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rfc1P35601 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfc1P35601 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms