Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpardP35396 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PpardP35396 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PpardP35396 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PpardP35396 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpardP35396 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpardP35396 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpardP35396 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms