Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rab18P35293 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rab18P35293 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms