Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp4P35123 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp4P35123 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp4P35123 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms