Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd1P33215 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms