Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnnd1P30999 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms