Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc1P29341 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms