Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcdP28867 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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