Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms