Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nckap1P28660 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms