Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa5P28312 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms