Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb3P28231 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms