Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjc1P28229 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms